¿Cómo afecta la castración al transcriptoma?

El transcriptoma es el conjunto de todas las moléculas de ARN mensajero en una célula o en una población de células. Se diferencia del exoma en que incluye solo aquellas moléculas de ARN que se encuentran en una población de células específica, y generalmente incluye la cantidad o concentración de cada molécula de ARN además de las identidades moleculares.

El término se puede aplicar al conjunto total de transcripciones en un organismo dado, o al subconjunto específico de transcripciones presentes en un tipo de célula particular. A diferencia del genoma, que se fija de forma aproximada para una línea celular dada (excluidas las mutaciones), el transcriptoma puede variar con las condiciones ambientales externas. Debido a que incluye todos los transcritos de ARNm en la célula, el transcriptoma refleja los genes que se expresan activamente en un momento dado, con la excepción de los fenómenos de degradación del ARNm, como la atenuación transcripcional. El estudio de transcriptómica , también conocido como perfil de expresión, examina el nivel de expresión de ARNm en una población de células determinada, a menudo utilizando técnicas de alto rendimiento basadas en la tecnología de microarrays de ADN. El uso de la tecnología de secuenciación de próxima generación para estudiar el transcriptoma a nivel de nucleótidos se conoce como ARN-Seq.

Los transcriptomes de las células madre y las células cancerosas son de particular interés para los investigadores que buscan comprender los procesos de diferenciación celular y carcinogénesis.

El análisis de los transcriptomes de ovocitos y embriones humanos se utiliza para comprender los mecanismos moleculares y las vías de señalización que controlan el desarrollo embrionario temprano, y podría ser teóricamente una herramienta poderosa para realizar una selección de embriones adecuada en la fertilización in vitro.

Transcriptómica es un campo emergente y en constante crecimiento en el descubrimiento de biomarcadores para su uso en la evaluación de la seguridad de los medicamentos o la evaluación de riesgos químicos.