Los probióticos no se usan para tratar la enfermedad de Lyme. Cuando se usan antibióticos para tratar la enfermedad de Lyme, los probióticos se toman aproximadamente a mitad de camino entre las dosis de antibióticos para reponer y mantener un bioma intestinal saludable.
Si esto no se hace, pueden ocurrir diarrea, dolor en el intestino, infecciones por hongos y posiblemente una infección por Clostridium dificile.
He tenido éxito probiótico con un régimen simple de tomar una cucharada de polvo acidófilo entre mis dosis de antibióticos, y el trozo ocasional de un buen queso cheddar también es probiótico.