Bioquímica: al hacer metabolómica, ¿cómo se distingue entre los metabolitos de la misma masa?

Esto es solo si ambos metabolitos coexisten en la muestra. Como dice la respuesta anterior, los pasos iniciales de separación química abordarían ese problema.

Incluso de lo contrario, cada compuesto se divide en sus iones secundarios de la misma manera cada vez. Un espectro de MS / MS es característico de ese compuesto.
Por lo tanto, incluso si dos metabolitos tienen la misma masa, sus fragmentos serán diferentes, lo que lleva a diferentes picos en el espectro de MSMS.

Realiza algún tipo de cromatografía / espectroscopia para diferenciarlos en función de la carga, hidrofobicidad, afinidad por alguna otra molécula de sustrato, solubilidad en diferentes medios y / o su absorción o fluorescencia de longitudes de onda de luz particulares. El procedimiento específico dependerá de las moléculas específicas en cuestión.