¿Podría el entorno celular (pH, temperatura, aglomeración molecular, estado redox) afectar el interactoma de una célula?

¡Si y si!

Muchas interacciones proteína-proteína solo ocurren bajo condiciones celulares o extracelulares muy específicas. Una búsqueda rápida y sucia de la literatura publicada en PubMed trajo más de 1.300 visitas para el término de búsqueda solo de interacción dependiente del pH, y esas son solo las que conocemos. Así que sí, una caracterización 100% completa del interactoma de una célula dada es prácticamente imposible, al igual que para una caracterización completa del transcriptoma, proteoma y epigenoma al 100%.

Absolutamente sí. Un proceso que viene a la mente es el transporte de hierro por la transferrina. La transferrina es una proteína que transporta hierro, ya que el hierro no es terriblemente soluble en soluciones acuosas. La transferrina cargada de hierro se une a su receptor y luego se internaliza en una vesícula. A partir de ahí, la vesícula se acidifica y libera el hierro de la transferrina. Por lo tanto, este es un ejemplo de muchos en los que la forma en que se comporta una proteína cambia en función del entorno químico.

Eric Vene