No se conocen las razones correctas de la ciclotimia, sino que es una consecuencia regular de los mismos elementos hereditarios que causan confusión bipolar. A decir verdad, existe un riesgo esperado del 15% a la mitad de que las personas con ciclotimia al final se determine que tienen confusión bipolar después de una hiper-escena total o tristeza significativa.