¿Cuáles son las ventajas / desventajas de la secuenciación de proteínas directamente en la secuenciación del ADN del verso?

No estoy seguro de tu historial, así que trataré de ser lo más simple posible. Si todo el ADN disponible en una célula se convierte en proteína, se crearía una gran cantidad de proteínas inútiles, útiles y muchas veces dañinas. El ADN disponible es una especie de tarjeta codificada (tarjeta perforada) que solía usarse para programar computadoras antiguas. El sensor solo leyó partes de la tarjeta (las partes con los agujeros) y las tradujo a un programa que la computadora podía entender y realizar. Del mismo modo, el ADN disponible contiene grandes segmentos que no están traducidos. La suposición común es que estos segmentos existen para controlar la mutación al destruir repentina y completamente un organismo (las posibilidades de que ocurra una mutación en las partes no codificadoras son mayores cuando hay un gran volumen de segmentos no codificantes disponibles). Estudios recientes también muestran que muchas proteínas están codificadas por los mismos segmentos, pero procesadas de manera diferente durante las modificaciones postraduccionales y postraduccionales. Nuestra comprensión de las PTM (modificaciones postraduccionales) a las proteínas todavía está en una etapa incipiente. Entonces, si hablamos de organismos complejos, es muy difícil saber de qué segmento del ADN del organismo proviene la proteína. También están los problemas de las correcciones postranscripcionales en el ARNm, la varianza de preferencia de codones en diferentes organismos. Entonces, en resumen, si su objetivo es simplemente encontrar cuál es la secuencia de la proteína, entonces es mejor secuenciar la proteína en sí misma que tratar de encontrar su ADN

¿Es esta una proteína que ya has aislado? ¿Estás tratando de detectar mutaciones en un genoma, verificar que has realizado una transfección con éxito o descubrir la composición de una proteína completamente desconocida que has extraído, independientemente de la célula que la produjo? Preguntas importantes

La diferencia clave es la tecnología que utilizas para hacer la secuencia. Para identificar las secuencias y cantidades relativas de una mezcla de fragmentos de proteínas desconocidas, es probable que desee espectrometría de masas. Para verificar la secuencia de un fragmento de ADN corto, por ejemplo, la secuencia de ADNc de una proteína, en un apuro podrías probar la secuenciación de ADN de Sanger. Para cantidades más grandes de ADN, utilice una de las tecnologías de secuenciación de próxima generación disponibles (alto rendimiento).