Uno de los factores que afecta la absorción de un medicamento es si el medicamento está ionizado o no. Un fármaco ionizado tendrá dificultades para atravesar las células epiteliales que revisten el tracto gastrointestinal, esto ocurre porque los iones no pueden difundirse libremente a través de las membranas celulares de las células epiteliales del tracto gastrointestinal.
Un medicamento ácido no sería ionizado en el estómago, donde el pH es bajo (ácido), por lo que sería capaz de atravesar las células epiteliales y entrar en la circulación sistémica, pero en el intestino delgado, donde el pH es alto (básico), el fármaco ser ionizado y la tasa de absorción sería lenta.
Por otro lado, un medicamento básico se ionizaría en el estómago y se absorbería lentamente, pero en el intestino delgado no sería ionizado y se absorbería más rápido.
Esto significa que una droga ácida comenzaría a ser absorbida tan pronto como ingrese al estómago, pero una droga básica necesitaría más tiempo para pasar el estómago y entrar al intestino delgado donde comenzaría a ser absorbida.