La agarosa es un polisacárido de algas marinas. Forma una matriz una vez que ha sido fundida y resolidificada. La agarosa se usa para ayudar a separar los ácidos nucleicos y las proteínas. En el caso de los ácidos nucleicos, hecho en un formato de gel horizontal. La separación se basa en el tamaño de la molécula / fragmento con piezas más pequeñas que se mueven más rápidamente a través de la matriz. El porcentaje de agarosa utilizada se puede modificar para separar mejor los fragmentos. Por ejemplo, si tuviera un pequeño fragmento que necesitaba de un plásmido más grande, podría aumentar el porcentaje del gel para evitar que la pieza más grande se mueva hacia el interior del gel mientras permite que la pieza más pequeña migre.
Para las proteínas, la agarosa se usa más comúnmente para crear cuentas para columnas. Sepharose es la forma con la que estoy más familiarizado, pero hay otras. Como estos se compactan fácilmente (destruyendo la columna), estos se usan generalmente para columnas de baja presión o gravedad. Típicamente, estos se usan en purificaciones de filtración en gel (es decir, las proteínas se mueven según el tamaño) pero también se pueden usar para reticular ligandos para la cromatografía de afinidad.
