La estructura primaria se refiere a la secuencia de residuos de aminoácidos en una cadena polipeptídica (las proteínas pueden estar hechas de múltiples cadenas), desde su extremo N hasta el extremo C. Tenga en cuenta que los aminoácidos se denominan residuos después de la síntesis de deshidratación cuando se combinan para formar un péptido. Hay veinte aminoácidos codificados por codones de ARNm.
La estructura primaria de una proteína determina sus otros niveles de estructura y, en última instancia, la función de la proteína.