Depende de los sistemas afectados. La mayoría de las infecciones fúngicas que se notan externamente son las de la piel. Un dermatólogo es el mejor preparado para diagnosticar y tratar afecciones de la piel, incluidos los diversos tipos de infecciones fúngicas. Las infecciones fúngicas orales o gastrointestinales serían tratadas por un médico de atención primaria o un gastroenterólogo. En algunos casos de exposición a especies de hongos raros, un médico de enfermedades infecciosas puede ser llamado para ayudar. Además, las infecciones fúngicas que afectan al pie serían tratadas por un médico de cabecera o un médico podiatra.
También es una consideración que algunas infecciones pueden ser manejables por agentes antifúngicos autoadministrados. Las instrucciones de empaque proporcionarán que las infecciones que no responden al tratamiento, aquellas que empeoran o si el tratamiento causa una reacción deben solicitar una visita a su médico de atención primaria.
