¿Los retrovirus endógenos humanos están relacionados con el aumento de enfermedades autoinmunes como la esclerosis múltiple, y la ciencia está reactivando y modificando estos virus?

Sí, los retrovirus pueden estar relacionados con enfermedades autoinmunes.
Todavía no sabemos cómo o si puede ser tratado.

Y no, no podemos reactivar los virus, lo hacen por sí mismos si el sistema inmunológico de una persona se deteriora.
Y no, no modificamos virus humanos. No podemos.