Si tiene tos flema y se vuelve más profunda después de 2 semanas ¿es neumonía?

Probablemente no.

Muchas tos durarán de 2 a 3 semanas y no requieren tratamiento. Ver por ejemplo:

http://www.rcgp.org.uk/clinical/…

La neumonía es más severa y, por lo general, causa los síntomas más graves que se enumeran. Si no está bien, debe buscar atención médica.