Te dirigiría al PDB (banco de datos de proteínas) para hacer una búsqueda. Puede tener suerte y encontrar algunos modelos interesantes. Sin embargo, no encontrará una respuesta completa porque aún no se ha dilucidado completamente.
Interesante investigación extraída de AP:
La metanfetamina (METH) es una importante amenaza de drogas en los Estados Unidos y en todo el mundo. La terapia con anticuerpos monoclonales (mAb) para tratar el abuso de METH está mostrando una promesa emocionante y la comprensión de cómo la estructura del mAb se relaciona con la función será esencial para el desarrollo futuro de estas terapias importantes. Los investigadores han determinado las estructuras cristalinas de un fragmento de anticuerpo de cadena sencilla terapéutica anti – (+) – METH de alta afinidad (scFv6H4, K (D) = 10 nM) derivado de uno de nuestros mAb candidatos en complejo con METH y el estereoisómero (+) de otra droga abusada, 3,4-methylenedioxymethamphetamine (MDMA), conocida por el nombre de la calle “éxtasis”. Las estructuras cristalinas revelaron que scFv6H4 se une a METH y MDMA en un bolsillo profundo que recubre casi por completo los fármacos principalmente a través de interacciones aromáticas. Además, el nitrógeno catiónico de METH y MDMA forma un puente de sal con el grupo carboxilato de un residuo de ácido glutámico y un enlace de hidrógeno con una cadena lateral de histidina. Curiosamente, hay dos moléculas de agua en el bolsillo de unión y una de ellas está posicionada para una interacción C-H … O con el anillo aromático de METH. Estas primeras estructuras cristalinas de un fragmento de anticuerpo terapéutico de alta afinidad contra METH y MDMA (resolución = 1,9 A y 2,4 A, respectivamente) proporcionan una base estructural para diseñar la próxima generación de anticuerpos de mayor afinidad y también para llevar a cabo la humanización racional.
