No estoy del todo seguro de lo que quieres decir. los pKa efectivos de ciertos residuos ácidos son más altos (y los pkB también son más altos) porque hay menos solvatación estabilizadora de estos residuos si los residuos son parte de una cadena polipeptídica, especialmente en una región hidrofóbica oculta de la solución a granel. Recuerde que el pKa / pKb informado del residuo de un aminoácido es el de un ácido libre en solución libre. Es por eso que estas calculadoras que tienes en línea son bastante difíciles.
esto es exactamente lo que impulsa todas las cosas asombrosas de la bioquímica, porque la acidez y las basicidades pueden cambiar dependiendo del entorno químico.
también recuerde que el citosol está “lleno” y se parece más a un gel, por lo que los coeficientes de actividad tienden a ser diferentes (pueden ser más bajos o más altos).
