La transcripción puede inhibirse por diversos medios:
- Represión: una molécula represora se une al sitio del operador cadena abajo de la secuencia del promotor y, por lo tanto, bloquea la unión de la ARN polimerasa al promotor.
- Secuencia del terminador: estos son tramos de secuencia complementaria que después de la transcripción por la ARN polimerasa forma una estructura tipo bucle y evita la transcripción de los elementos aguas abajo.
- Bloqueo por moléculas pequeñas: algunas moléculas pequeñas como alfa-amanitina pueden afectar la actividad de la ARN polimerasa y, por lo tanto, hacer que no funcionen.
- Pérdida de las condiciones fisiológicas adecuadas: la ARN polimerasa es una enzima y actúa solo en condiciones de pH y temperatura adecuadas. Cualquier alteración de sus condiciones naturales causará efectos perjudiciales a su actividad e inhibirá la transcripción.
