Todo depende de cuán avanzada sea la presentación.
Para un curso de bioquímica de pregrado, solo un resumen básico del proceso de proteómica de escopeta LC-MS / MS sería bueno. Para hacerlo interesante, definitivamente hable de los parámetros geniales en los experimentos modernos de proteómica. En mis propios experimentos, puedo identificar más de 200,000 péptidos (¡sí 200,000!) En un lisado celular completo. Esto corresponde a algo así como 8000 proteínas diferentes! El instrumento que uso es de resolución lo suficientemente alta como para poder diferenciar entre dos compuestos donde la única diferencia en su masa son pequeñas diferencias basadas en la interacción fuerte (¡esa fuerza fundamental en la física con la que los biólogos no podemos jugar a menudo! ) Este instrumento también es lo suficientemente rápido para medir 20 compuestos por segundo.
Si está dando una presentación avanzada a personas que ya tienen una comprensión básica de la proteómica, ¿podría sugerir una charla sobre la proteómica química? Este subcampo de la proteómica usa métodos cuantitativos para determinar rápidamente los coeficientes de unión de nuevos fármacos y compuestos en proteomas completos. Antes de esto, si quisieras averiguar el coeficiente de unión de un compuesto a un objetivo específico necesitarías purificar el objetivo y ejecutar experimentos bioquímicos de la vieja escuela sobre él. Esto le da un resultado realmente preciso, pero es muy parcial hacia lo que cree que su compuesto es vinculante y muy lento y laborioso. Ahora, con la proteómica química, puede realizar varios miles de ensayos de unión de este tipo en todo el proteoma. La idea es que esto acelerará el proceso de validación de medicamentos y proporcionará ideas para posibles objetivos no relacionados con un medicamento que podría estar provocando efectos secundarios y toxicidad no deseados.
