Definitivamente sí, pero debes mirar las celdas correctas. El VIH se integra en el genoma de las células que infecta, por lo tanto, la secuenciación profunda del ADN de estas células revelará los genomas del VIH. Dado que el principal receptor de la infección por VIH es la molécula CD4, tendrá que observar las células CD4 positivas para encontrarla. Estos incluyen linfocitos, monocitos / macrófagos y células dentríticas. En la práctica, generalmente observará PBMC circulantes (células mononucleares de sangre periférica) o células de biopsias de ganglios linfáticos.
Si tuvieras que analizar las células CD4 negativas, digamos el tejido muscular, no deberías encontrar ningún genoma del VIH, aunque lo más probable es que tengas algunas células infectadas por el VIH en tu muestra que provienen de la “contaminación” de las células sanguíneas.
De hecho, hay varios estudios en la literatura que analizan la integración del VIH en células de individuos infectados.
Los sitios específicos de integración del VIH están relacionados con la expansión clonal y la persistencia de las células infectadas
