¿Hay enfermedades que afectan solo a los humanos?

Viruela (erradicada), virus de la inmunodeficiencia humana VIH.

Si entiendo su pregunta correctamente, entonces argumentaría que sí, y debido a esto los presentes son los mejores objetivos para la erradicación.
La viruela es un ejemplo de un virus que existe únicamente en seres humanos, por lo que cuando se diseñó y utilizó una estrategia de vacuna eficaz, no tenía a dónde ir y, como tal, se ha erradicado.
Otros posibles objetivos de erradicación son la poliomielitis, las paperas, la dracunculosis, la filariasis linfática (elefantiasis), el sarampión, la rubéola, la tenia del cerdo y posiblemente incluso la malaria.