¿La secuenciación económica del genoma conducirá a una cura para el cáncer?

La respuesta breve es no, ninguna tecnología existente será una panacea para curar todos los cánceres.

Pero la historia completa es que la secuenciación del genoma de bajo costo y la tecnología relacionada, la secuenciación transcriptoma ayudará mucho y de varias maneras. Menos útilmente, la secuenciación del genoma también mejorará en gran medida la precisión del pronóstico del cáncer. Trataré de resumir varias de las formas en que la secuenciación del genoma de bajo costo está mejorando o mejorará el tratamiento del cáncer, pero es probable que muchas de ellas no podamos imaginarnos dado el estado actual del campo. También hay algunos que podemos imaginar, como el tratamiento que describes, pero que pueden o no ser viables. Finalmente, resumiré algunos de los desafíos prácticos al aplicar la secuenciación del genoma al tratamiento del cáncer.

En primer lugar, la secuenciación del genoma de bajo costo será útil para predecir qué tratamientos serán efectivos . Lo primero que debe recordar sobre el cáncer es que no es una enfermedad; es muchos Por lo tanto, las mejoras en el tratamiento han sido incrementales en lugar de disruptivas. La secuenciación de genoma barata, probablemente sea parte de esta tendencia al menos hasta que surja una tecnología realmente disruptiva. Conocer el perfil genético del paciente puede informar la elección del tratamiento. Esto ya está sucediendo, el ejemplo más famoso son los genes BRCA. Los cánceres de ovario en pacientes con mutaciones en estos genes son tratables con cisplatino. Ahora, por supuesto, este es solo un ejemplo, y uno solo debe genotipar dos genes en lugar de todo el genoma. Sin embargo, cuando la secuenciación del genoma sea más económica y las herramientas para interpretar rápidamente los resultados estén más desarrolladas, descubriremos estas reglas sistemáticamente. Esto ayudará a los oncólogos a tomar decisiones más informadas sobre qué tratamientos usar en más, tal vez incluso, todos los cánceres y evitar la quimioterapia innecesaria. Además, cuando los datos estén disponibles para un número lo suficientemente grande de pacientes y tumores, podremos detectar efectos similares que dependen de las interacciones entre múltiples genes.

En segundo lugar, a medida que la secuenciación genética se vuelve más barata, muchas otras tecnologías pueden aprovechar las mejoras de costos. La secuenciación de ARN , también llamada secuenciación de transcriptoma (mi área personal de especialización) le brinda información más allá de la secuencia de ADN. Te dice qué genes están siendo utilizados en realidad por una célula y, junto con la secuenciación del genoma, puede decirte qué mutaciones son realmente relevantes. La secuenciación del tumor es otra tecnología que se volverá más común. Foundation Medicine comenzó a desarrollar una plataforma de diagnóstico basada en la secuenciación del cáncer. En el mundo académico, la investigación básica que utiliza esta tecnología es muy activa y probablemente conduzca a un grupo de objetivos de tratamiento viables.

En tercer lugar, la secuenciación puede ayudar a diagnosticar y subclasificar cánceres de forma más rápida, fácil y precisa. Actualmente, esto puede ser bastante difícil ya que requiere varias pruebas de laboratorio y la opinión de un patólogo, todo depende del tipo de cáncer. Cuando la secuenciación del genoma sea lo suficientemente barata, una mayor parte de este proceso será automatizable y, por lo tanto, será práctico detectar más cánceres de forma más rutinaria y proporcionar a los oncólogos más información. Esto significa que los cánceres se detectarán y clasificarán tan pronto como se desarrollen y no cuando comiencen a mostrar síntomas . Dado que cuando se trata de tratar tumores o lesiones precancerosas, la detección temprana es el nombre del juego, la detección automática también mejorará en gran medida los resultados.

Ninguna de las estrategias que he descrito será fácil y, aunque las tres ya comenzaron a mejorar la atención, pasarán muchos años antes de que lleguen a buen término. Las posibles dificultades son tan numerosas como la cantidad de pacientes con cáncer. Sin embargo, la promesa de la secuenciación del genoma se realizará a tiempo.

Hay muchas preguntas diferentes aquí. En resumen, parece que a lo que se refiere es a la medicina personalizada, que consiste en encontrar tratamientos basados ​​en su perfil genético específico. Hasta cierto punto, esto ya existe. Hay una serie de medicamentos que se dirigen a cánceres que se caracterizan por una determinada mutación.

En cuanto a la identificación de llamadas de cáncer, la secuencia de ellas puede no ser necesaria. Los tumores se pueden identificar más fácilmente por otros medios y hemos podido diagnosticar el cáncer durante mucho tiempo. En otras palabras, no hay necesidad de buscar una secuencia de ADN ofensiva, ya que hay otros biomarcadores disponibles. Desafortunadamente, la parte difícil es la medicina de ingeniería que puede apuntar con precisión a las células cancerosas.

También hay un aspecto legal en su pregunta. Las soluciones farmacéuticas completamente personalizadas no son realmente posibles dado que cada nuevo medicamento debe pasar por extensos ensayos clínicos. Lo que podemos esperar de manera realista son soluciones para subtipos de cáncer particulares. En ese caso, la secuenciación del genoma completo no sería necesaria para determinar el tratamiento más efectivo.

Una secuenciación más económica nos permitirá comprender mejor por qué surgió el cáncer de un paciente en primer lugar y cómo se desarrolló a medida que el tumor creció y se diseminó potencialmente a través de la metástasis. Comprender este proceso ayudará a diseñar nuevos medicamentos que puedan detener la oncogénesis (formación de cáncer) en momentos cruciales, así como a seleccionar entre las terapias disponibles y adaptarlas a las mutaciones descubiertas. Al mismo tiempo, conocer las mutaciones por sí solo es insuficiente para el diagnóstico y el tratamiento. Podemos usar marcadores de superficie celular para diagnosticar y clasificar tumores, y estos mismos marcadores de superficie celular se utilizan para la administración de terapia dirigida. Para aprovechar las mutaciones involucradas, también debemos entender el mecanismo exacto por el cual la secuencia de ADN mutada se transcribe y procesa a nivel del transcriptoma (como ARN) y cuáles son los cambios exactos en el fenotipo (expresión de la proteína). . La secuenciación más rápida, más precisa y más económica será una herramienta clave utilizada por los investigadores para avanzar en este campo, y un número creciente de aplicaciones clínicas ayudará a los pacientes en el futuro.