El género Salmonella es parte de la familia de Enterobacteriaceae. Su taxonomía ha sido revisada y tiene el potencial de confundir. El género comprende dos especies, Salmonella bongori y Salmonella enterica , la última de las cuales se divide en seis subespecies: S. e. enterica , S. e. salamae , S. e. arizonae , S. e. Diarizonae , S. e. houtenae y S. e. indica
El grupo taxonómico contiene más de 2500 serotipos (también serovares) definidos sobre la base de los antígenos somáticos O (lipopolisacárido) y H flagelar (la clasificación Kauffman-White). El nombre completo de un serotipo se da como, por ejemplo, Salmonella enterica subsp. enterica serotipo Typhimurium, pero se puede abreviar a Salmonella Typhimurium.
