La mayoría de las veces los cambios son muy pequeños y no pueden considerarse “físicos”. Por ejemplo, si el antibiótico A funciona inhibiendo una enzima importante en la célula, la resistencia puede surgir cuando la enzima objetivo cambia un aminoácido de una manera que ya no puede ser reconocido por el antibiótico. En este caso, el antibiótico A entra en la célula pero no puede inhibir su objetivo.
Como otro ejemplo, un canal en la membrana que normalmente transporta la molécula B desde el citoplasma al entorno, puede cambiar un aminoácido y obtener la capacidad de transportar el antibiótico A desde la célula. En este caso, el antibiótico ingresa a las células, pero antes de que tenga tiempo de causar el daño, se transporta hacia afuera.
Otros casos de resistencia pueden ser más complicados. A veces, una bacteria tiene un plásmido (una pequeña porción circular de ADN además de su genoma) que contiene un gen de resistencia. Por ejemplo, un gen que codifica una enzima que degrada el antibiótico. Esta bacteria en condiciones especiales puede copiar su plásmido y enviarlo a su vecino. En este caso, el vecino tendrá una nueva enzima y cuando se encuentre con el antibiótico, sería resistente a ella.
