Existen diferentes complejos AP en mamíferos. AP1 es responsable del transporte de hidrolasas lisosomales entre la red trans-Golgi y los endosomas.
El complejo adaptador AP2 se asocia con la membrana plasmática y es responsable de la endocitosis.
AP3 es responsable del tráfico de proteínas a los lisosomas y otros orgánulos relacionados.
AP4 está menos bien caracterizado. AP4 un complejo proteína-4 adaptador identificado recientemente que media la clasificación de proteínas en células de mamíferos. El complejo AP-4 se expresa ubicuamente en muchas regiones del cerebro, con localización en las estructuras similares a Golgi en los cuerpos celulares y dendritas de las neuronas.
Y hay otro: AP-5. El complejo AP-5 recientemente descubierto parece estar involucrado en la dinámica endosomal; su localización y función precisas aún no están claras. Curiosamente, la deficiencia de AP-5 también está asociada con paraplejía espástica progresiva, lo que sugiere que AP-5, como AP-4, juega un papel fundamental en el desarrollo neuronal y la homeostasis.