La mayoría de los medicamentos ayurvédicos son muy seguros incluso para un uso a largo plazo. Sin embargo, las personas pueden tener alergias, molestias abdominales, etc. incluso en las formas más suaves de alimentos. Por lo tanto, no está bien decir que los medicamentos ayurvédicos son completamente libres de efectos secundarios. El concepto en Ayurveda es que cualquier cosa que sea muy poderosa también será potencialmente dañina.
Sin embargo, la elección del medicamento dependerá de la afección. Si un problema puede resolverse con una intervención leve como la dieta o la modificación del estilo de vida, es el más seguro. Las hierbas ayurvédicas son más poderosas que los alimentos pero menos poderosas que los componentes químicos puros aislados o las drogas. También hay algunas plantas muy tóxicas. Se sabe que son tóxicos y se administran con el cuidado y las precauciones adecuadas en algunas condiciones específicas que justifican su uso y no en todas las condiciones.
La duración del tratamiento también dependerá de la naturaleza del problema. Hay condiciones como la flatulencia y la acidez que responderán minutos después de la administración del medicamento y hay condiciones en las que la patente tendrá que consumir medicamentos de por vida.
