Los subtipos de HPV responsables de la mayoría de los cánceres cervicales (y presumiblemente del pene) son los Tipos 16 y 18, mientras que los responsables de alrededor del 90% de las verrugas genitales son los Tipos 6 y 11, por lo que las verrugas y el cáncer no son manifestaciones del mismo subtipo. Dicho esto, normalmente no hay síntomas de ningún tipo de VPH a menos que se desarrollen papilomas (verrugas) o tumores, pero la mayoría de las infecciones ocurren en personas más jóvenes y son autolimitadas (el sistema inmune las eliminará).
Los cánceres de pene son relativamente raros en los hombres, aunque son más comunes en los hombres no circuncidados, donde el ambiente cubierto y húmedo es propicio para el VPH. Dado que el virus es completamente epitelial, en la capa superior de la piel, es algo así como tener un cáncer de piel, y el tratamiento es similar si se detecta temprano (mediante una simple inspección). El VPH cervical tiene una ventaja en la producción de tumores que están “fuera de la vista”, pero también son de crecimiento lento y altamente tratables. El tiempo transcurrido desde la infección que se vuelve persistente hasta la transformación maligna (cáncer) suele ser del orden de años o décadas: la edad media (la mitad más joven, la mitad más) para hombres con cáncer del pene es 68 y el 80% de los casos ocurre en hombres 55.
