¿Cómo saben las enzimas de transcripción la secuencia de ADN que se traducirá en una proteína requerida?

La respuesta de Emily Czinege es genial. Voy a tomar una perspectiva ligeramente diferente sobre esta pregunta y proporcionar algunos otros detalles. Como ella describió, hay una clase de proteínas llamadas factores de transcripción que reconocen ciertas secuencias de ADN, tienen un dominio dentro de ellas que es estructuralmente compatible con esa secuencia de ADN.

(Crédito de la imagen: Cys2His2 Zinc Finger Proteins)

Los factores de transcripción luego reclutarán otras proteínas, incluidas las enzimas, con el propósito de iniciar la transcripción o bloquear la transcripción, dependiendo del contexto.

¿Qué es este contexto? Eso es lo que trato de abordar. Un contexto importante que no puedo ignorar son las señales hormonales. Existe una clase de factores de transcripción, los receptores de hormonas nucleares, que se unen con hormonas en nuestro cuerpo. Los principales son el estrógeno, la testosterona, la hormona tiroidea y el cortisol (hormona del estrés). En todos los casos, la hormona es lo que controla el comportamiento del receptor en un gen. En la mayoría de los casos, no pueden unirse al ADN sin la presencia de la hormona. Sin unión al ADN, sin regulación génica.

Pero, también hay factores de transcripción que no requieren una hormona. Un método que están controlados es a través de lo que se denomina una modificación postraduccional (PTM). Una PTM es una modificación química de una proteína que se realiza después de que se sintetiza. Estos son a menudo reversibles. Una de las modificaciones más comunes es la fosforilación, la adición de un grupo fosfato a la proteína).

(Crédito de la imagen: FOSFORILACIÓN DE PROTEÍNA: UN REGULADOR GLOBAL DE LA ACTIVIDAD CELULAR)

La fosforilación altera la estructura de una proteína, y los factores de transcripción son objetivos de la fosforilación. Estas modificaciones químicas pueden servir para activar un factor de transcripción o apagarlo. O, para decirlo de otra manera, la fosforilación puede hacer que un factor de transcripción se una al ADN o puede hacer que no pueda unirse al ADN. La fosforilación también puede servir para alterar qué enzimas puede reclutar un factor de transcripción. Sin fosforilación, puede reclutar enzimas que bloquean la transcripción y cuando se fosforila puede reclutar enzimas para mejorar la transcripción, o viceversa.

Un ejemplo que puedo usar es p53, que es un regulador maestro de una célula y un supresor tumoral muy importante. Puede activar la muerte celular en condiciones ambientales e intracelulares adecuadas. Por ejemplo, si hay una combinación de exposición a los rayos UV y daño al ADN, hará que la célula se autodestruya. Cuando esto no sucede, existe un mayor riesgo de formación de tumores. Dependiendo de las condiciones, p53 puede o no estar fosforilado en diferentes regiones de la proteína.

(Crédito de la imagen: sitios de fosforilación de p53)

Cada modificación proviene de una respuesta celular diferente y conduce a p53 que actúa sobre diferentes genes. Las manchas verdes son enzimas diferentes que alteran p53. Algunos ejemplos de la imagen son la exposición a los rayos UV, la exposición infrarroja y el calor excesivo. Las células necesitan diferentes respuestas a cada una de ellas, y p53 actúa sobre diferentes genes en el caso de alcance, ya que las diferentes condiciones conducen a diferentes modificaciones químicas del factor de transcripción.

Las enzimas de transcripción no. Interactúan con otras moléculas que sí lo hacen, llamadas factores de transcripción .

Los factores de transcripción tienen una forma muy específica que se adapta al ADN, pero solo si es la secuencia correcta; qué secuencia es la correcta depende del tipo de factor de transcripción. Flotan alrededor del núcleo hasta que encuentran un trozo de ADN que coincide, y luego se sientan en él. Las regiones en las que se sientan se llaman regiones promotoras .

Además de interactuar con el ADN, los factores de transcripción interactúan con las enzimas de transcripción. Al proporcionar una ubicación energéticamente estable para la maquinaria de transcripción, “reclutan” la polimerasa a esa región y allí se iniciará el proceso de transcripción. Por lo tanto, la región promotora es lo que señala los factores de transcripción a la presencia de un gen, y esto da como resultado que la transcripción se inicie allí.

La transcripción continúa hasta que otra proteína detiene la polimerasa en un proceso similar. Tenga en cuenta que la transcripción no comienza ni se detiene en un codón de parada. Solo la traducción lee los codones.

La situación se vuelve más complicada cuando nos damos cuenta de que los factores de transcripción también pueden interactuar entre sí. Y también pueden tener un impacto negativo en la transcripción. Por lo tanto, varios factores de transcripción compiten por una mancha en el promotor, y dependiendo de sus concentraciones, el gen se activa o desactiva en diferentes grados.

Además, dado que los factores de transcripción son proteínas que deben transcribirse, muchos factores de transcripción activan y desactivan la transcripción de otros factores de transcripción.

Es perfectamente normal si necesita leer eso nuevamente para procesarlo.

Estas interacciones entre los genes del factor de transcripción forman una red genética . De lo anterior podemos concluir que la forma en que la célula lee los genes no es constante en absoluto, sino que forma un sistema finamente sintonizado que cambia con el tiempo y en respuesta a estímulos externos. Esta es la principal forma en que la célula administra qué proteínas se van a transcribir en un momento dado, y cómo coordina procesos complejos como la replicación y la especialización.