A veces. Las etiquetas más grandes como GFP invariablemente tendrán un mayor efecto en la función de la proteína que las etiquetas más pequeñas como la suya.
Los investigadores generalmente prueban la función de la proteína de fusión para ver que coinciden razonablemente con la del tipo salvaje. Por ejemplo, la solubilidad es una gran preocupación ya que algunas proteínas marcadas se precipitan. Buscan ver si la proteína de fusión se localiza correctamente, interactúa con sus socios, se modifica post-traduccionalmente, se secreta o se fracciona de acuerdo con su ubicación celular.
