¿Qué modelos matemáticos o lógicos pueden usarse para simular procesos bioquímicos con vías cíclicas?

Cadenas de Markov, tal vez. Ese es un enfoque potencialmente demasiado rico para los ciclos de ida. En un diagrama de flujo para un proceso continuo, hay una ecuación diferencial que rige cada parte. Los economistas hacen un buen estudio de encontrar equilibrios para los procesos; la biología puede ser más desordenada, (para los lepidópteros en particular, oigo) incluso la necesidad de herramientas de la teoría del caos (la dinámica de la población es el ejemplo clásico y cíclico) .

En lo que respecta al conocimiento de mi laico, bueno, un enfoque de aprendizaje automático no implementará tanto como tratar de simular un modelo lógico. Cualquiera de las técnicas populares que de ninguna manera estoy calificado para mencionar (con una apariencia de debida diligencia) podría ser útil. Por ejemplo, atacando grandes números con la aproximación de monte carlo o aprendiendo estrategias misteriosas para ayudar al cálculo numérico de ecuaciones diferenciales difíciles de manejar.