La eliminación del estómago puede ser parcial o total.
La extirpación parcial generalmente se realiza para un problema en el estómago distal. La eliminación del estómago distal reduce la producción de ácido en más del 70%. Sin embargo, la pérdida de enzimas gástricas no tiene un impacto importante, ya que son compensadas por las enzimas pancreáticas. Un impacto importante de la eliminación del estómago distal es la pérdida de músculo pilórico que regula la entrada de alimentos mezclados con ácido gástrico en el intestino (duodeno) y evita el reflujo del contenido duodenal, incluida la bilis en el estómago. La pérdida de este músculo provoca la entrada de ácido en el duodeno o el yeyuno (según el tipo de reconstrucción) que conduce a un fenómeno llamado síndrome de dumping asociado con dolor y malestar y, en ocasiones, diarrea. El reflujo de la bilis al estómago causa gastritis por reflujo biliar que causa dolor y bilis al vomitar.
Si se elimina todo el estómago, se pierde la función de mezclar y moler y, por lo tanto, es imposible comer una comida grande ya que los alimentos entran directamente en el intestino por la pipa de alimento. Debido a la pérdida de producción de ácido, la absorción de hierro y calcio por vía oral se reduce y requiere la administración de suplementos inyectables. Además, la vitamina B12 oral no puede ser absorbida y necesita suplementos inyectables.
Existe una larga lista de problemas colectivamente llamados síndromes post gastrectomía y mantener una buena calidad de vida requiere un cumplimiento diligente de las instrucciones, pero es posible.