La pielonefritis (pus en el riñón) se debe a las bacterias. La bacteria puede llegar al riñón a través del torrente sanguíneo (diseminación hematógena) o de una infección que se origina más abajo del tracto (infección ascendente). Naturalmente, el pus en el riñón se drenará con la orina (pyruria) a menos que esté amurallada en un absceso. En la pionefrosis, la situación no es solo acerca de un absceso en el riñón. Inicialmente, el paso de la orina se bloquea debido a una obstrucción en el tracto urinario, como una piedra urinaria y, por lo tanto, la orina y el pus se acumulan en el riñón.
La infección se debe principalmente a las bacterias y la especie más común es Escherichia coli (E.coli), generalmente del recto y las heces. Más comúnmente, especies de Candida de levaduras y otros hongos también pueden causar una infección. También es importante tener en cuenta que una infección por hongos es también un factor predisponente en la pionefrosis cuando las bolas de hongos pueden causar una obstrucción del tracto urinario. Esto es más probable que ocurra en una persona con un sistema inmune debilitado, como en el VIH / SIDA, y las personas que han usado antibióticos durante períodos prolongados.
Otras bacterias que pueden causar pyonephrosis incluyen especies de Enterococcus, Enterobacter, Klebsiella, Proteus, Pseudomonas, Bacteroides, Staphylococcus y Salmonella. Staphylococcus aureus resistente a la meticilina (SARM) también puede causar pyonephrosis y a veces es difícil de tratar. Un caso infeccioso menos común es Mycobacterium tuberculosis, el organismo responsable de la tuberculosis (TB). M. tuberculosis puede causar una infección y un estrechamiento del uréter (estenosis).
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