La formación de inmunidad a largo plazo en el cuerpo no requiere agentes vivos. Incluso los fragmentos de bacterias lisadas pueden tener anticuerpos contra ellos. Algunas inmunizaciones, por ejemplo, simplemente usan partes de las paredes celulares o membranas de agentes infecciosos en lugar de darle una entera, porque el cuerpo puede seguir adelante y reconocer esas partes y formar anticuerpos contra ellas.
Teniendo esto en cuenta, realmente no hay ninguna razón de por qué tomar antibióticos dañará la capacidad del cuerpo para grabar una respuesta inmune recordada. Estos medicamentos no eliminan físicamente las bacterias, sin dejar rastros. Algunos interfieren con la síntesis de la membrana celular o de la membrana celular, la síntesis de proteínas, etc. No mata directamente a la bacteria. Inhibe algunas funciones vitales que la bacteria necesita y, en consecuencia, el agente muere a medida que continúa creciendo. Fragmentos del agente seguirán presentes en el cuerpo y se montará una respuesta inmune.
Curiosamente, el choque séptico generalmente es causado por fragmentos de las paredes celulares bacterianas, no por la célula completa. No es necesario que esté vivo.