¿Te refieres a la estructura 3D del ADN en complejo con algo de proteína? Para eso, en la suite en línea tienes POLYVIEW 3d. Pero te recomiendo que vayas a buscar herramientas sin conexión como pymol, visor de PDB suizo … por nombrar algunas.
Bioinformática: ¿Cuáles son algunas bases de datos en línea para predecir y visualizar estructuras tridimensionales de ADN?
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¿Por qué los ratones / ratas tienen más eventos de daño al ADN / día que los humanos?
Si tiene más de una transfusión de sangre de 5 litros, ¿su ADN permanecerá igual?
ARN: ¿Qué determina la velocidad a la que ocurre la transcripción?
Prueba el servidor make-na. Genera doble cadena de ADN de forma A y B arbitraria. Sin embargo, no visualiza la estructura. Para eso, vea la respuesta de Dhaval Naik o pruebe mi herramienta favorita Chimera (Página de Inicio de UCSF Chimera).
¿Cuánto tiempo un tramo de ADN (¿Cuántos pares de bases)? ¿Qué resolución (moléculas de ADN individuales o cromatina: 30 nm de fibra, 150 de fibra)? ¿Qué organismo (ratón, levadura, humano, etc.)?
- Si está trabajando con datos 3C / 4C / 5C / HiC y con la resolución de la fibra de cromatina (por ejemplo, 30 nm o más), entonces buscaré en los siguientes documentos las herramientas disponibles:
https://scholar.google.com/schol …
(Esta es solo la lista de documentos que citaba la “Inferencia Bayesiana de Organizaciones Espaciales de Cromosomas”, quienes a su vez desarrollaron una herramienta utilizada por varios otros documentos).
Nuestro laboratorio, en particular, tiene una herramienta para generar la estructura 3D de todo el genoma de la levadura. Ver
Gursoy y otros
“Efecto de la arquitectura del núcleo celular en los principios plegables del genoma 3D de la levadura en ciernes”
Esta herramienta estará disponible para su descarga en breve.
