Existen al menos tres mecanismos conocidos para que el colágeno recientemente secretado se integre con la matriz extracelular existente. Las hebras de colágeno individuales forman triples hélices entre sí, lo que resulta en un procolágeno diestro similar a una hélice alfa. La secuencia de aminoácidos para hebras de colágeno individuales generalmente tiene un tema Pro-X-Gly que se repite. Cuando una porción de uno o más hilos de colágeno se extravía de este tema, una bobina de procolágeno más suelta resulta en esa ubicación. Hay alguna oportunidad para la integración de otros filamentos de colágeno en esa región respirable. Este mecanismo ha sido denominado teoría de invasión de hebras.
También hay evidencia de que una de las invasiones más significativas de colágeno nuevo en las matrices existentes ocurre a intervalos regulares a lo largo de las fibrillas de colágeno. Estas fibrillas son estructuras más grandes compuestas de bobinas de procolágeno agrupadas. Dado que las fibrillas se acumulan en patrones regulares para formar fibras incluso más grandes, existe una oportunidad en intervalos longitudinales regulares para que una estructura de colágeno más nueva se integre en la rotura de extremo a extremo entre las fibrillas. Este mecanismo fue estudiado por Xiao Mo en Angewandte Chemie, edición 45 (2006): 2267-2270.
Ninguna de estas explicaciones involucra uno de los factores más prominentes en el proceso de curación de heridas: las proteasas. Estas enzimas son secretadas por las células, lo que permite la reorganización de la matriz circundante a medida que las células migran y proliferan. El tipo de proteasa y la identidad de la célula que la produce variará según el tipo de tejido, la extensión del daño y el tiempo transcurrido desde la agresión.
