Aquí hay algunas diferencias importantes:
- En la PCR, el ADN a replicar se separa por desnaturalización térmica. In vivo , el ADN está separado por una helicasa dependiente de ATP.
- In vivo , las ADN primasas producen cebadores de ARN de una manera independiente de la secuencia en el ADN monocatenario expuesto. La actividad 5 ‘-> 3’ exonucleasa para degradar los cebadores de ARN es, por lo tanto, innecesaria para la PCR. (Antes de Taq, la polimerasa primaria utilizada para la PCR era el fragmento de Klenow).
- Las horquillas de replicación del ADN (y los fragmentos de Okazaki asociados con la síntesis de la cadena rezagada) no ocurren en la PCR.
- La tasa de síntesis de ADN es de 1 kb / s en E. coli pero de 1-4 kb / min en una reacción de PCR típica. Las tasas de incorporación incorrecta son más altas en las reacciones de PCR usando Taq que en los organismos modelo típicos (1 en 9000 para Taq frente a 1 en 100.000 para Pol δ / ε en mamíferos).
