Se cree que los compuestos basados en arsénico son mucho más inestables en presencia de agua que los compuestos basados en fósforo. Eso presumiblemente conducirá a una mayor tasa de mutaciones porque habrá más interrupciones de ADN.
Además, el arsénico reacciona fácilmente con otros compuestos presentes en la célula, como los tioles que están presentes en las enzimas. En las células normales que no contienen arsénico, el arsénico reduce la tasa de muchas enzimas, incluidas las enzimas de reparación del ADN. Por lo tanto, en estas células, la presencia de arsénico aumenta la tasa de mutación indirectamente al reducir la capacidad de la célula para reparar su ADN. Un organismo con ADN basado en arsénico podría desarrollar enzimas de reparación del ADN que son más resistentes a la toxicidad del arsénico, pero no está claro cuánta resistencia es químicamente posible (sin otros cambios masivos en la composición de proteínas). Recuerde que incluso el organismo GFAJ-1 que se informa que es muy resistente al arsénico crece mejor en presencia de solo fósforo.