¿De qué manera nuestro cuerpo dice a las bacterias beneficiosas de las patógenas y sabe qué bacterias conservar y contra las que montar una respuesta inmune?

La respuesta de Ian York es un buen comienzo. Añadiría que muchas de las bacterias amigables con las que evolucionamos conjuntamente producen cantidades sustanciales de varios compuestos antiinflamatorios, que tienden a “calmar” la respuesta inmune.

Una razón por la cual matar a las bacterias buenas es dañino puede ser que, sin su efecto antiinflamatorio, el sistema inmunitario se vuelve demasiado agresivo y ataca nuestras propias células. Por lo tanto, el uso excesivo de antibióticos y desinfectantes, particularmente en la infancia, puede causar enfermedades autoinmunes indirectamente.

Coadaptación.

Las respuestas inmunes son metabólicamente caras y corren el riesgo de perder el control y convertirse en enfermedades inflamatorias o autoinmunes. Los organismos cuyo sistema inmune atacan a las bacterias indiscriminadamente estarían en una seria desventaja reproductiva.

Las bacterias, por supuesto, no son espectadores pasivos en este proceso. Muchos de ellos se ocultan del sistema inmune o secretan compuestos que suprimen la respuesta inmune. Algunos, como la piel comensal de S. epidermidis , incluso secretan moléculas que activan el sistema inmune contra los patógenos (eliminando así a sus competidores).

Muchas bacterias potencialmente patógenas son toleradas a bajos niveles por períodos indefinidos de tiempo. Sin embargo, si “estallan”, comienzan a causar daño tisular y se multiplican en niveles altos, el sistema inmunitario se activará de manera general y específica contra ellos en un intento de controlar la infección.

El sistema inmune es muy ad hoc y acumulativo. Aunque existen algunos mecanismos para el reconocimiento específico y la tolerancia de las bacterias “buenas”, la mayoría aprende al responder a los problemas.