No es imposible. La vacunación original contra la viruela utilizaba viruela vacuna, un virus relacionado que era lo suficientemente similar a la viruela para que funcionara.
Pero en la práctica real puede no importar mucho. Un patógeno viral en humanos podría tener parientes cercanos (por ejemplo, en las vacas) que sean lo suficientemente similares como para ser eliminados por una sola vacuna. Y estos parientes cercanos muy probablemente también son patogénicos, es decir, causan enfermedades en las vacas ya que sus parientes causan enfermedades en los humanos. Pero dudo mucho que erradicar la viruela bovina junto con la viruela tenga algún efecto negativo en las vacas. Por un lado, el sistema inmunitario humano permanece dentro del cuerpo.
La única forma en que esto podría tener un efecto importante es si los humanos son un huésped intermedio. Pero de nuevo, dudo que detener el ciclo de transmisión de la viruela va a tener efectos negativos en las vacas