Hola María, la proteína Cas9 ha sido modificada en una amplia variedad de formas inteligentes para expandir sus usos potenciales. Sin embargo, la secuencia original de aminoácidos de Cas9 no ha cambiado mucho en la mayoría de estos y podría utilizarla ‘tal cual’ en la mayoría de los casos. En general, la secuencia se mantiene igual en el nivel de aminoácidos, pero se ha cambiado a nivel de ADN para “optimizar codones” para su uso en diferentes especies, es decir, cada aminoácido puede ser codificado por unas pocas combinaciones de tripletes de ADN denominados codones y algunos de estos codones se transforman en proteínas de manera más eficaz que otros (dependiendo de la especie en particular, cada especie tiene su conjunto de codones favorito para cada aminoácido).
Los cambios en el nivel de aminoácidos son más bien pequeñas adiciones, como agregar una señal de localización nuclear al principio o al final que ayuda a Cas9 a permanecer en el núcleo donde se guarda el ADN (las bacterias no necesitan esto, por lo que el Cas9 original no t tienen estas señales). Otros cambios comunes incluyen agregar una pequeña etiqueta (como la etiqueta Bandera o Ha que le permite rastrear la proteína más adelante).
Cas9 también se puede usar para controlar la expresión génica en lugar de cortar el ADN. Para ello, se cambian un par de aminoácidos en la secuencia principal que impide que pueda cortar el ADN, y luego se agregan secuencias de proteínas adicionales que le permiten manipular la expresión génica (por ejemplo, las partes clave de los factores de transcripción de los virus )
