Habitualmente, las estructuras cuaternarias de las proteínas se estabilizan y las subunidades se mantienen juntas mediante interacciones moleculares “débiles”, pero numerosas no covalentes, como enlaces de hidrógeno, interacciones hidrofóbicas e iónicas Van der Waals, como se mencionó anteriormente.
Sin embargo, se puede formar un enlace covalente (llamado enlace disulfuro) entre residuos de cisteína de diferentes subunidades, que también contribuyen a la estabilización de la estructura cuaternaria. Un buen ejemplo son las estructuras cuaternarias anti cuerpos, como se ve en la imagen siguiente: