Bueno, para empezar, no hay un análogo de PCR para las proteínas. Cuando secuenciamos nucleótidos, estamos utilizando una reacción que incorpora un nucleótido complementario a lo que está presente, una y otra vez. Al etiquetar esos nucleótidos, podemos decir qué se incorpora e inferir la secuencia del capítulo original. No existe tal reacción para las proteínas, por lo que la “secuenciación” se convierte en un desafío.
Sin embargo, no todo está perdido. Todavía tenemos espectrometría de masas como herramienta para descubrir la secuencia de proteínas. El enfoque más común es descomponer las proteínas en pequeños fragmentos y determinar sus masas. Al agrupar fragmentos que pasan por la máquina al mismo tiempo, tenemos una idea de qué aminoácidos componen la proteína, y podemos averiguar cuál fue la proteína original computacionalmente. No ayuda mucho con la “secuenciación” de proteínas de novo , a menos que tenga una proteína purificada para jugar con ella. Pero es mucho mejor que nada.