¿Por qué las proteínas virales rara vez se reconocen como PAMPS?

Aquí está mi suposición. Que el PAMP puede ser identificado por nuestro sistema inmune innato es porque esas moléculas son radicalmente diferentes de las de los humanos.

Las bacterias son organismos radicalmente diferentes a los humanos. Las bacterias son procariotas, mientras que los humanos son eucariotas. Entonces las moléculas sintetizadas por bacterias son distintas de las humanas. Por ejemplo, la pared celular bacteriana está compuesta de peptidoglicano y lipopolisacárido (LPS), que las células humanas no se sintetizan normalmente, por lo que estas moléculas poseen firmas distintas. Es por eso que LPS es un buen PAMP. Por el contrario, la membrana celular humana está cubierta por glicoproteínas, que se sintetizan en el aparato de Golgi. Si bien las bacterias no tienen aparato de Golgi, por lo que las glicoproteínas rara vez se ven en las bacterias, en su caso. De modo que es muy fácil para nuestro sistema inmune innato distinguir bacterias y células humanas por sus membranas externas.

Sin embargo, las proteínas de la envoltura viral también son glicoproteínas. Porque los virus usurpan nuestra maquinaria celular, incluido el aparato de Golgi, para producir sus glicoproteínas. ¡Entonces esas proteínas de envoltura viral no son diferentes a la nuestra! Entonces necesitamos inmunidad adquirida para proteínas virales.

Y es por eso que la bacteriemia puede causar síntomas directamente mientras que la viremia no tiene efecto. Debido a que el LPS puede desencadenar la respuesta inmune, resulta en septicemia o shock endotóxico. Si bien las proteínas virales no se perciben como moléculas extrañas, por lo que no desencadenan una reacción inmune fuerte.

Actualización: las glucoproteínas virales causan la activación de los receptores de reconocimiento de patrones (PRR), ejemplos incluyen RSV, sarampión, CMV y HSV, de acuerdo con este documento Innate Sensing of Viruses por Toll-Like Receptors.
Pero el autor también mencionó que tal fenómeno es intrigante:

La capacidad de las glicoproteínas para estimular los TLR es intrigante porque se sintetizan dentro de las células huésped y, por lo tanto, no albergan de forma intuitiva modificaciones o restos que difieran significativamente de los del huésped. Es posible que estas proteínas posean conformaciones estructurales únicas y / o grupos de glicanos que las proteínas del huésped no suponen. Parece muy probable que se muestre algún patrón subyacente común que sea particular de las glicoproteínas de los virus. El trabajo futuro, sin duda, tendrá como objetivo definir las bases moleculares de los PAMP en las glicoproteínas de la envoltura viral.