Ha sido usado por mucho tiempo.
Algunos de los primeros trabajos en programación de lógica inductiva se aplicaron al diseño de fármacos a principios de los 90, por ejemplo: diseño de fármacos mediante aprendizaje automático: el uso de programación de lógica inductiva para modelar las relaciones estructura-actividad de análogos de trimetoprim que se unen a dihidrofolato reductasa.
Se puede encontrar un artículo más reciente en Machine Learning for Drug Design