Hay tres amplias categorías de antígenos que no están bien presentados por MHC clase I:
- Antígenos propios
- Proteínas que son altamente resistentes a la degradación
- Proteínas que no contienen un motivo de unión apropiado para una molécula MHC de clase I particular
Los autoantígenos generalmente no causan enfermedades, con la principal excepción son las proteínas priónicas; Como era de esperar, los priones no causan una respuesta inmune (o causan muy poca respuesta inmune).
Las proteínas resistentes a la degradación pueden ser más teóricas que reales. Durante bastante tiempo, se creyó que la proteína EBNA1 del virus de Epstein-Barr resistía la presentación del antígeno al degradarse muy lentamente, pero creo que ahora se considera que es a lo sumo un mecanismo secundario. No conozco ningún otro ejemplo, y el modelo de procesamiento de antígenos “DRiPs” de Jon Yewdell lo hace menos probable de todos modos (dependiendo de cuánto pienses que los DRiPs contribuyen a la presentación de antígenos).
La tercera posibilidad es muy interesante, porque en teoría podría ser un contribuyente significativo a la enfermedad en regiones donde un alelo MHC de clase I es muy común. (No es probable que exista una gran diversidad de MHC, porque eso significa que hay muchos motivos vinculantes para evitar un patógeno). Se han propuesto un par de ejemplos para esto, siendo la cepa de malaria la más plausible. África, que aparentemente mutó para evitar la presentación del alelo de MHC clase I más común en la región. Esto, por supuesto, es probable que sea solo una estrategia transitoriamente exitosa para el patógeno, ya que es uno de los impulsores teóricos de la diversidad dependiente de la frecuencia en los alelos MHC.
