En primer lugar, para comprender la razón detrás de la terapia adaptada contra el cáncer, debe comprender las causas del cáncer. Aunque es una definición generalizada que el cáncer es una masa de células con un potencial de crecimiento infinito, pero es el genoma en el que se pueden encontrar las razones detrás de este potencial. La actual década de 2005 fue testigo de una revolución masiva a medida que las tecnologías de secuenciación se desarrollaron en una progresión casi geométrica. La genómica ha recorrido un largo camino desde la secuenciación de Sanger en la era anterior hasta la actual Illumina y otras plataformas de secuenciación de próxima generación.
El enfoque de Genómica hacia el cáncer ha llevado a la comprensión de la progresión de varios tipos de cáncer mediante el estudio de las mutaciones denominadas mutaciones de conductor y pasajero en el genoma. Sabemos que hay varias clases de genes que necesitan ser mutados para que el cáncer progrese. Estos son supresores de tumores, genes que protegen a nuestras células del cáncer, por lo que deben ser inactivados por mutaciones y oncogenes. Estos genes necesitan ser sobreactivados por mutaciones, pero nuevamente estas son solo mutaciones, solo cambios en el ADN. O, por ejemplo, amplificaciones del mismo gen: no está mutado, pero ahora, en lugar de una copia del gen, obtienes diez copias del gen. Y eso es suficiente para crear la célula cancerosa. Entonces, las mutaciones pueden no ser realmente los cambios en la secuencia de ADN, puede haber ciertas aberraciones en la intrincada maquinaria de regulación de estos genes que causa una inactivación de los supresores tumorales o que causa la expresión ectópica de los oncogenes.
Pero las mutaciones realmente no pueden alcanzar posiciones específicas. Esa es la esencia de la teoría de la evolución darwiniana de que las mutaciones ocurren al azar. Eso significa que las células están sentadas y esperando la siguiente mutación, y ahora estamos hablando de cáncer, por lo que las células cancerosas están esperando a que suceda la siguiente mutación. Cuando esta mutación ocurre en una de las células, la célula se hará cargo de la población y formará una nueva capa de cáncer, si lo desea. En biología llamamos a esta selección clonal, es decir, una población particular de células se vuelve dominante.
Sin embargo, las células están sentadas y esperando la mutación correcta, por lo que están obteniendo mutaciones aleatorias. Y en general se están cansando de estas mutaciones aleatorias. Estas mutaciones se denominan colectivamente “pasajeros”. Entonces esas mutaciones que conducen la progresión del cáncer se llaman ‘controladores’ y otras se llaman ‘pasajeros’. En general, se “cree” que los pasajeros son neutrales, no juegan ningún papel en el cáncer. Porque los conductores son generalmente los mismos en diferentes pacientes, pero los pasajeros son todos diferentes.
Así que uno de los principales centros de atención de la genómica actual del cáncer es el perfil del genoma del cáncer de varios pacientes y, basándose en la mutación específica del pasajero y del conductor, adapta una terapia específica para el paciente. Además, esto era necesario dada la naturaleza altamente heterogénea del cáncer. Con mucho, varios trastornos en la historia médica podrían ser diagnosticados y tratados por determinados síntomas y objetivos fijos, pero en el cáncer no es el caso. Además, ahora también se observa que la capacidad de respuesta y reversión diferencial de los pacientes con cáncer a la radioterapia y la quimioterapia se debe a que ciertos pacientes están genéticamente predispuestos a hacerlo.
Con mucho, el proyecto del genoma 1000 nos ha dado solo los datos de la secuencia del exoma, así que esto solo nos proporciona información sobre las mutaciones del conductor y del pasajero de las regiones codificantes del genoma del cáncer, que es mucho menos que el genoma completo. Sin embargo, esta información también ha llevado a creer que la genómica tiene mucho potencial para determinar la terapia del cáncer para cada paciente en función de su predisposición genética. Por lo tanto, dado el nivel de complejidad que posee el cáncer, Genomics por mucho ofrece el mejor enfoque posible para diseñar terapias muy confiables.