La región interna de las bicapas de lípidos es de naturaleza hidrófoba ya que las colas hidrófobas se apilan una contra la otra y la cabeza hidrófila se encuentra inmersa en el disolvente en el exterior.
Los segmentos transmembrana de proteína son de naturaleza hidrófoba y, por lo tanto, son estables dentro de las capas biológicas de lípidos. Las técnicas de predicción transmembrana implican caracterizar las partes de la proteína en términos de su hidrofobicidad y predecir qué partes de ella sobresalen en la célula, qué partes sobresalen y cuántas veces la cadena de proteína cruza la membrana.
