Como su nombre indica, las proteínas de membrana se encuentran en las membranas celulares. Por lo general, cada uno de ellos tiene una función específica, y esa función requiere que se extienda más allá de la membrana. Algunas proteínas de membrana se sientan en la superficie. Otros están anclados en la membrana y tienen piezas llamadas dominios en uno o ambos lados de la misma.
Las proteínas de membrana realizan una variedad de funciones vitales para la supervivencia de los organismos. Las proteínas del receptor de membrana transmiten señales entre los ambientes interno y externo de la célula, las proteínas de transporte mueven moléculas e iones a través de la membrana, las enzimas de la membrana pueden tener muchas actividades, como oxidorreductasa, transferasa o hidrolasa. Las moléculas de adhesión celular permiten que las células se identifiquen e interactúen. Por ejemplo, proteínas involucradas en la respuesta inmune.