Su pregunta necesita ser reescrita brevemente:
“¿Por qué los humanos son competitivos para predecir la estructura de las proteínas en comparación con las computadoras?”
Su pregunta inicial implica una comparación contra el plegamiento de proteínas. CASP, el punto de referencia utilizado para la comparación, es una evaluación crítica de la predicción de la estructura, NO de plegamiento de proteínas.
Ahora para responder la pregunta corregida:
Considérese usted mismo como un excursionista varado en las montañas: está aproximadamente en la cúspide y su destino es la cabina de rescate en la parte inferior de la montaña (minimas globales). Hay numerosas trampas (minimas locales) y peligros.
Usando un algoritmo de minimización de energía (por ejemplo, descenso de gradiente), el excursionista simplemente rueda colina abajo a lo largo del camino con la pendiente más pronunciada. Lo más probable es que se quede estancado en un mínimo local. Luego, un helicóptero mágico lo lleva a otro máximo y rueda aleatoriamente en otra dirección. Enjuague y repita. Esto obviamente no es muy eficiente.
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Sin embargo, dado que somos excursionistas y tenemos cerebro + ojos, podemos identificar el conjunto correcto de vías que pueden conducir a la cabina. En otras palabras, creemos que la intuición visual humana y el razonamiento espacial pueden ayudarnos a doblar las proteínas y eludir las temidas minimas locales. ¡Los datos sugieren que los jugadores de Fold It! son capaces de identificar estas áreas problemáticas (tirando de las cadenas de aspecto problemático).
De nuevo, esta es una manera muy poco rigurosa de explicar las cosas.
