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Excelentes artículos de Investigación en profundidad

Investigación del cáncer: ¿Cuál es la sensibilidad y especificidad de las mutaciones BRCA1 y 2?

BRCA 1 y 2 son mutaciones genéticas identificadas que pueden colocar a las mujeres en mayor riesgo de una serie de cánceres, especialmente cáncer de mama y de ovario. El problema al responder a esta pregunta es que…

¿Por qué el xenón (Xe), un gas noble, tiene un efecto anestésico?

Mi comprensión es similar a la de Pieter, ya que nadie sabe realmente por qué los gases nobles y los pequeños gases diatómicos como el hidrógeno y el nitrógeno tienen propiedades anestésicas. Krypton es un anestésico bajo condiciones…

¿Cuál es el mejor ensayo para determinar la afinidad de unión de las proteínas A y B, donde la proteína A se clona y expresa en células de mamíferos y la proteína B se regula positivamente en respuesta a la expresión heteróloga de A?

A lo largo de los años, se han desarrollado una gran cantidad de métodos para estudiar las interacciones proteína-proteína, que incluyen Y2H (híbrido de levadura 2), TAP (purificación de afinidad en tándem), Co-IP (Coinmunoprecipitación), ensayos de pull-down, etc.…

¿Por qué un alto número de residuos de prolina ralentiza la migración de SDS-PAGE?

Las proteínas con un alto contenido de prolina son conocidas por correr más lento que su peso molecular real durante SDS-PAGE. La explicación más intuitiva para esto es que las prolinas introducen “grietas” naturales en la proteína que…

¿Qué proteínas tienen una homología de secuencia muy alta, pero una función muy diferente?

Restringiré mi definición de función a forma. ¡Este grupo logró que una secuencia de proteínas adoptara dos pliegues al introducir solo una mutación! Paquete de 3 hélice (3-α) hoja beta más alfa-hélice (4β + α) Una secuencia más…

¿Por qué los humanos son competitivos para predecir la estructura de las proteínas en comparación con las computadoras?

Su pregunta necesita ser reescrita brevemente: “¿Por qué los humanos son competitivos para predecir la estructura de las proteínas en comparación con las computadoras?” Su pregunta inicial implica una comparación contra el plegamiento de proteínas. CASP, el punto…

¿Cuáles son los contaminantes más comunes después de la purificación de níquel marcada con histidina?

La proteína marcada con His mediante una purificación de resina Ni-NTA es un protocolo realmente desordenado, a pesar de que es altamente eficiente. Proporciona muchas proteínas no específicas, la mayoría de las cuales (sorpresa sorpresa) contienen una alta…

Diseño de fármacos: ¿Cuál es la diferencia entre “ab initio” y “in silico” para las interacciones de unión a proteínas?

Ab initio: desde el principio Esencialmente significa desde los primeros principios, pero también a veces significa sin ningún sesgo añadido en la forma de un campo externo / término o fuerza potencial, para guiar el enlace. Esto podría…

¿Puedes predecir si una molécula es o no un agonista o un antagonista de un receptor ab initio?

Esto puede no parecer una respuesta satisfactoria, pero es lo mejor que puedo reunir: Sospecho que no puedes. ¿Por qué? Considere la gran diversidad de moléculas que se unen al receptor opioide mu: hay agonistas, antagonistas, agonistas parciales,…

¿Qué métodos se utilizan para determinar si una proteína sufre un cambio conformacional en determinadas circunstancias?

La respuesta a su pregunta casi describe qué tipo de describe lo que una gran parte de los bioquímicos / biofísicos hacen para ganarse la vida. La respuesta a su pregunta es muy amplia y trataré de cubrir…

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