El paradigma tradicional para el diagnóstico es analizar el nivel de una molécula y deducir un estado de enfermedad desde ese nivel. Este es el paradigma de los biomarcadores: una molécula indica una enfermedad.
El problema con el paradigma de biomarcadores es que el concepto subyacente es defectuoso. La evolución es desordenada y ad hoc: nuestros sistemas inmunológico, metabólico, nervioso y endocrino tienen múltiples niveles de control, tienen varios tipos de redundancia y todos se ven afectados e integrados con todos los demás sistemas de nuestro cuerpo. Los biomarcadores únicos son altamente informativos para algunas afecciones, pero en muchos casos, el cáncer es el más notorio, o bien se pierden enfermedades por completo o producen falsos positivos que conducen a un tratamiento excesivo.
La transcriptómica y la proteómica prometen proporcionar una forma mucho más completa y precisa para detectar y caracterizar la salud y la enfermedad. Ambas tecnologías examinan miles de marcadores (ARN mensajero para transcriptómica, proteínas para proteómica) de forma simultánea, y deducen información sobre la salud y la enfermedad a partir de patrones de expresión excesiva e insuficiente de estos marcadores. La comparación de estos patrones en pacientes sanos y enfermos permite desarrollar una “firma”, a menudo para muchas enfermedades a la vez, y estas firmas son mucho más sólidas y confiables que cualquier biomarcador único.
Ahora se han informado las firmas proteómicas para varios estados patológicos problemáticos, que incluyen firmas para distrofia muscular de Duchenne [1], cáncer de pulmón no microcítico [2], enfermedad de Alzheimer [3], cáncer de próstata [4], mesotelioma [5] y para distinguir las infecciones virales de las bacterianas [6]. Se ha informado una firma para la edad cronológica [7].
Estas firmas no solo prometen mayores niveles de precisión que los biomarcadores individuales, sino que serán mucho más útiles para identificar estrategias terapéuticas adaptadas al paciente.
En este momento, estas pruebas son lentas y relativamente costosas. Pero esto cambiará a medida que las tecnologías maduren, y podemos esperar que las pruebas basadas en firmas ingresen al mercado de diagnósticos en los próximos años. Este es un trato mucho más grande que cualquier cosa que Theranos alguna vez podría esperar alcanzar.
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Divulgación: soy un ex empleado y accionista actual de SomaLogic, una empresa de proteómica.
Notas a pie de página
[1] http://www.pnas.org/content/112/…
[2] http://download.springer.com/sta…
[3] http: //www.alzheimersanddementia…
[4] Análisis proteómico de los exosomas del cáncer utilizando una plataforma de matriz basada en el aptámero modificada nueva (SOMAscanTM)
[5] http://www.plosone.org/article/f…
[6] Una nueva firma de proteoma del huésped para distinguir entre infecciones bacterianas y virales agudas.
[7] Firmas proteómicas circulantes de la edad cronológica
