Puede haber una amplia gama de problemas que surgen cuando el hipotálamo está dañado. Todo depende de dónde está el daño, porque hay una variedad de núcleos o regiones individuales en el hipotálamo que median diferentes tipos de comportamiento. En general, el hipotálamo regula la mayoría de los procesos en el cuerpo que aseguran la supervivencia y la propagación de la especie. Una forma de que esto se describa es que el hipotálamo es responsable de las 4 Fs: alimentarse, huir, luchar y aparearse.
El daño a diferentes partes del hipotálamo puede causar problemas con cualquiera de estos. También está involucrado en procesos como la regulación de la temperatura, ciclos de sueño y regulación de fluidos en el cuerpo. Como ya se ha mencionado en las otras respuestas, el hipotálamo también regula la actividad del sistema hormonal en el cuerpo, activando el lóbulo anterior o posterior de la glándula pituitaria. Por lo tanto, el daño que le impide controlar el sistema de hormonas puede conducir a una gran cantidad de problemas diversos en todo el cuerpo.
Una función especialmente importante que desempeña es activar la respuesta al estrés, también conocida como respuesta de lucha o huida. Hace esto cuando recibe información de la amígdala con el efecto de que existe una amenaza. El hipotálamo no solo activa directamente el núcleo de la glándula suprarrenal, que se encuentra sobre el riñón, para liberar la adrenalina, sino que también regula la glándula pituitaria, que controla la liberación de la hormona del estrés cortisol. Debido a que el hipotálamo también regula la respuesta de relajación, al activar el sistema parasimpático, juega un papel importante en la regulación de si la respuesta al estrés se activa o no. En la medida en que uno pueda mantener un estado relajado, se evitará la respuesta al estrés. Esta es la razón por la cual la mayoría de las terapias para el estrés y la ansiedad implican entrenamiento de relajación.