Una vez que un niño ha tenido una infección con un enterovirus específico, por lo general son inmunes a ese virus en particular de por vida. Sin embargo, hay muchos filamentos de enterovirus y la inmunidad desarrollada no es para todos. Los niños siguen siendo vulnerables a las infecciones con otros filamentos, aunque puede haber una inmunidad parcial a la infección con un enterovirus que tiene un parecido molecular muy cercano al de la cadena original.
Después de estar expuesto a muchos tipos de enterovirus, la inmunidad desarrollada cubre (al menos parcialmente) la mayoría de los filamentos a los que el cuerpo aún no ha estado expuesto. Esta es la razón por la cual las infecciones tienden a volverse menos severas a medida que los niños crecen.